Cуперкомпьютеры: администрирование
Шрифт:
Служебные узлы
Все узлы, не включённые в счётное поле, – служебные. Совмещать функции вычислительного и служебного узла (например, NFS-сервера) крайне не рекомендуется, так как это наверняка приведёт к разбалансировке работы заданий и повышению вероятности отказа сервиса. Существует несколько ролей, которые выполняют служебные узлы, но часто один сервер выполняет несколько ролей, а то и все сразу.
Рассмотрим типичные роли. В больших вычислительных комплексах не всегда бывает удобно нагружать управляющие узлы пользовательскими и служебными системными процессами. Например, если установлены вычислительные узлы с разными версиями операционных систем, то совсем неудобно производить сборку пользовательских программ на управляющем узле, логичнее выделить несколько узлов для компиляции
Для защиты от несанкционированного доступа к системным службам и чувствительным данным (например, база данных паролей пользователей) обычно функции управляющих узлов разносят на две группы: узлы доступа и узлы управления. Узлы доступа предназначены для входа пользователей и их дальнейшей работы в системе, а узлы управления – для работы системы управления заданиями.
Практически в любом кластере есть сетевая файловая система, а значит, и сервер для неё, а нередко – целая ферма, если файловая система распределённая. Довольно распространённым служебным узлом является лицензионный сервер, на котором располагаются специальные службы, отвечающие за лицензирование коммерческих программ и утилит. Например, может использоваться сервер лицензий FlexLM для нескольких коммерческих пакетов. Расположение лицензионных служб на отдельной машине оправдано как с точки зрения безопасности (защита от кражи лицензионных файлов), так и с точки зрения повышения отказоустойчивости комплекса в целом. Обязательно запишите MAC-адрес этого сервера, при его внезапной замене для большинства программ будет достаточно установить на новом сервере старый MAC-адрес. И не забудьте запросить перевыпуск лицензии для нового сервера, конечно, с его настоящим MAC-адресом.
В современных вычислительных комплексах довольно часто встречаются узлы подготовки входных и обработки выходных данных (так называемые узлы пред/постобработки, от англ. pre- и postprocessing). Такие узлы отличаются б'oльшим объёмом оперативной памяти, чем на остальных узлах (256 Гбайт и более), что крайне важно для подготовки больших заданий и обработки результатов расчётов.
Часто полезными являются так называемые узлы визуализации. Обычно это выделенные серверы со специальными графическими картами для обработки визуальной информации и выдачи готовой картинки через сеть удалённому пользователю. Это бывает удобным, в частности, для удалённой подготовки заданий к расчёту (например, для визуализации сеток и иных входных данных). Узлы визуализации могут играть роль узлов пре/постобработки.
Для организации распределённого хранилища данных могут быть использованы узлы хранения данных. К каждому такому узлу подключается своё собственное дисковое хранилище, а все узлы хранения объединяются в единую сеть с общим доступом к файловой системе со всех узлов (подробнее об этом – в следующем разделе).
Среди служебных узлов также могут быть выделенные узлы:
• резервного копирования;
• удалённой загрузки;
• развёртывания ПО;
• авторизации и аутентификации;
• удалённого журналирования;
• сбора и обработки данных мониторинга;
• сбора и отображения статистики и состояния оборудования;
• служебных баз данных;
• и др.
Всё зависит от того, какие нужды у пользователей и администраторов вычислительного комплекса.
Сетевое оборудование
Компьютерные сети позволяют организовать взаимодействия компьютеров между собой. Для их построения применяется специальное оборудование: это сетевые карты и коммутаторы. В кластерах, как правило, имеются как минимум две сети. Одна, называемая служебной, выполняет те же функции, что и обычная локальная компьютерная сеть, другая обеспечивает обмен данными между вычислительными заданиями на разных узлах.
Наиболее серьёзные требования предъявляются к коммуникационной сети. Для характеристик возможностей сетей используются два основных параметра: пропускная способность и латентность.
Пропускная способность характеризует, какой наибольший объём информации может быть передан в единицу времени (чаще всего это секунда). Производители сетевого оборудования нередко указывают пиковую пропускную
способность. В реальных приложениях, как правило, наблюдается скорость в 1,5-2 раза ниже пиковой. Термин латентность (задержка) – это чистое время на передачу сообщения нулевой длины. Оно в первую очередь зависит от времени, затрачиваемого сетевыми устройствами и системой на подготовку к передаче и получению информации.Пропускная способность и латентность позволяют оценить, насколько эффективно будут считаться задания на кластере. Если задание требует частого обмена данными между узлами, то использование сетевого оборудования с большой латентностью приведёт к тому, что б'oльшая часть времени будет тратиться не на передачу данных, а на подготовку, а узлы будут простаивать. При малой пропускной способности обмен данными между узлами не будет успевать за скоростью счёта задания, что тоже скажется отрицательно на производительности: узлы будут тратить много времени на ожидание данных по сети.
Латентность и пропускная способность сети в первую очередь определяются используемой технологией передачи данных. Наиболее широко распространённой сетевой технологией является Ethernet, но её параметры удовлетворяют только требованиям, предъявляемым для организации служебной сети кластера, для сетей обмена данными используются менее известные, но более высокоскоростные сети.
Таблица 1: некоторые характеристики сетевых технологий
В таблице 1 приведены наиболее применяемые в кластерах сетевые технологии и их типичные характеристики. При проектировании сетей для вычислительных кластеров следует рассмотреть ещё один немаловажный вопрос – цену. Если не вдаваться в детали, то каждая сетевая карта высокоскоростной сети стоит около 1 000$, а цена коммуникатора может колебаться от 10 000$ до 1 000 000$ и выше. На сегодняшний день наиболее популярной технологией при построении кластеров для создания сетей обмена данными является технология InfiniBand. Причины её популярности связаны с хорошим соотношением между ценой и возможностями оборудования, доступностью программного обеспечения.
Некоторые сети могут использовать лишь один вариант топологии (способа коммутации узлов сети). Например, GigabitEthernet поддерживает только топологию «звезда», но так как в реальных приложениях она используется только совместно с TCP/IP, то допускается объединять несколько «звёзд» каналами, настроив маршрутизацию.
InfiniBand позволяет использовать практически любые топологии, которые поддерживаются установленным Subnet Manager. Стандартные реализации Subnet Manager поддерживают топологии «звезда», «дерево», «толстое дерево», «гиперкуб», но появляются и новые реализации. За счёт того, что в InfiniBand допускаются множественные маршруты, для средних конфигураций неплохо подходит топология «толстое дерево», которая хорошо использует дублирующиеся каналы. Топология – важный фактор эффективности сети. Наличие «узких мест» в топологии может свести на нет высокую скорость сети. Например, два GigabitEthernet-коммутатора, соединённых одним каналом, – явно не лучшее решение. А если соединять их несколькими каналами, то необходимо позаботиться о том, чтобы они объединялись на уровне коммутатора. Такое объединение поддерживается многими видами сетевого оборудования, существуют стандартные технологии, например EtherChannel, bonding, trunking. Важно заранее убедиться, что все стороны, участвующие в таком объединении, используют одинаковые стандарты (например, bonding может быть реализован по-разному у разных производителей).
InfiniBand
Мы отдельно останавливаемся на описании сетевой технологии InfiniBand, так как, с одной стороны, эта технология является широко распространённой в мире высокопроизводительных вычислений, и многим администраторам HPC-кластеров приходится в своей деятельности сталкиваться с этой технологией, а с другой стороны, InfiniBand довольно сильно отличается от привычных большинству администраторов сетей Ethernet, и при первом знакомстве возникает множество затруднений. При этом информации по InfiniBand немного, особенно на русском языке, хотя в последнее время ситуация улучшается.